Regional arbeidsgiveravgift ble fra 1. januar 2004 kjent ulovlig av ESA/EFTA-domstolen. Ordningen måtte derfor legges om slik at den ble i samsvar med statsstøtteregelverket i EØS-avtalen.

I perioden 2004-2006 har den differensierte arbeidsgiveravgiften økt fra 5,1 % til 11,7 %. Fra 1. januar 2007 gjenninnføres imidlertid den differensiert arbeidsgiveravgiften i alle kommuner i Nordland med unntak av Bodø. Mens Bodø får 7,9 % vil de øvrige kommunene igjen få 5,1 %.

Innovasjonsprogrammet ble avsluttet i 2008.